Werribee City U21 är ett australiensiskt fotbollslag från Melbourne, Victoria. Laget spelar i National Premier Leagues Victoria 2, som är den tredje nivån i det australiensiska ligasystemet. Werribee City U21 är en del av Werribee City Football Club, som grundades 1978. Laget spelar sina hemmamatcher på City Vista Recreation Reserve.
Werribee City U21 har haft framgångar i National Premier Leagues Victoria 2, och har vunnit ligan två gånger, 2017 och 2019. Laget har också deltagit i Dockerty Cup, som är en cuptävling för lag från Victoria i de lägre divisionerna. Werribee City U21s bästa resultat i Dockerty Cup är en andraplats 2019.
Några av Werribee City U21s mest kända spelare är:
* Josh Brillante (Newcastle Jets, FC Twente, Borussia Mönchengladbach)
* Bailey Wright (Preston North End, Bristol City, Sunderland)
* Awer Mabil (Midtjylland, Kasımpaşa, Cadiz)